1. 临床医学专业：该专业是皖南医学院的主干专业，下设多个方向，如临床医学、医学影像学、麻醉学等。该专业在南校区和北校区都有开设。
2. 护理学专业：该专业是皖南医学院的特色专业之一，旨在培养具有较高护理技能和护理管理能力的护理人才。该专业在南校区和北校区都有开设。
3. 医学影像学专业：该专业是临床医学的一个重要分支，主要涉及医学影像技术的运用和诊断。该专业在南校区开设。
4. 医学检验学专业：该专业是临床医学的一个重要分支，主要涉及医学检验技术的运用和诊断。该专业在北校区开设。
5. 药学专业：该专业是皖南医学院的传统优势学科之一，主要培养从事药物研究、开发、生产、管理等方面的高级药学人才。该专业在南校区开设。
6. 预防医学专业：该专业是皖南医学院的一个特色学科，主要培养从事疾病预防控制、公共卫生管理等方面的高级人才。该专业在北校区开设。
皖南医学院的专业分布在南校区和北校区都有分布，但各校区的专业设置不完全相同。在南校区，主要以临床医学、护理学、医学影像学等主干专业为主；在北校区，主要以药学、预防医学等特色专业为主。同时，皖南医学院还有其他的本科专业，如口腔医学、法医学等。
