环境工程专业全国高校排名如下：

1. 清华大学
2. 北京大学
3. 南京大学
4. 浙江大学
5. 上海交通大学
6. 复旦大学
7. 武汉大学
8. 西安交通大学
9. 哈尔滨工业大学
10. 华中科技大学
11. 中国科学技术大学
12. 山东大学
13. 天津大学
14. 华南理工大学
15. 北京工业大学
16. 东南大学
17. 四川大学
18. 厦门大学
19. 北京化工大学
20. 大连理工大学
21. 中国农业大学
22. 东北大学
23. 中国海洋大学
24. 西北农林科技大学
25. 中南大学
26. 北京师范大学
27. 重庆大学
28. 山东农业大学
29. 北京林业大学
30. 东北师范大学
31. 安徽师范大学
32. 苏州大学
33. 上海海洋大学
34. 中国地质大学（武汉）
35. 中国石油大学（华东）
36. 湖南师范大学
37. 河南师范大学
38. 华北电力大学（北京）
39. 中国地质大学（北京）
40. 东华理工大学