内蒙古高考理科340分能上的最好的大学有4所，分别是：

1. 吉林外国语大学：最低分数为340分
2. 河西学院：最低分数为340分
3. 南京医科大学康达学院：最低分数为340分
4. 南京审计大学金审学院：最低分数为340分

内蒙古高考理科359分能上的最好的大学有5所，分别为：

1. 南京审计大学金审学院：最低分数为359分
2. 南京医科大学康达学院：最低分数为359分
3. 河西学院：最低分数为359分
4. 吉林外国语大学：最低分数为359分
5. 南京邮电大学通达学院：最低分数为359分