南昌大学设有本科专业近百个，涵盖经济学、法学、教育学、文学、历史学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学等9个学科门类。其中，国家级特色专业有13个，包括汉语言文学、英语、化学、食品质量与安全、自动化、计算机科学与技术、软件工程、生物科学、材料科学与工程、食品工程、临床医学、管理科学等。此外，南昌大学还有13个省级特色专业，如经济学、法学、信息与计算科学、电子信息工程、材料成型及控制工程等。
南昌大学最有名的专业之一是食品科学与工程。该专业是江西省品牌专业建设点，是南昌大学食品科学与工程学院的主体专业，具有悠久的历史。该专业培养具有化学、生物学、食品工程原理、食品营养学、食品安全性与卫生学、食品工艺学等方面的基本理论和实践技能，能在食品领域从事食品生产技术管理、品质控制、产品开发、工程设计等方面的高级工程技术人才。该专业师资力量雄厚，现有教授15人，副教授30人，其中博士生导师10人，硕士生导师25人。
南昌大学的另一个著名专业是计算机科学与技术。该专业培养具有良好的科学素养，系统地掌握计算机软件与硬件的基本理论与应用技能，能在科研部门、教育单位、企业、事业、技术和行政管理部门等单位从事计算机教学、科学研究和应用的高等工程技术人才。该专业拥有优秀的师资队伍，现有专任教师80人，其中教授22人，副教授24人。
南昌大学还拥有许多其他优秀的专业和学科，如材料科学与工程、软件工程、生物科学等。这些专业都具有深厚的学术积淀和优秀的师资队伍，在江西省乃至全国都具有较高的声誉和影响力。
总的来说，南昌大学的专业设置丰富多样，涵盖了多个学科门类。其中，食品科学与工程和计算机科学与技术等专业在国内外享有盛誉，是南昌大学的王牌专业之一。
