新疆高考理科成绩为395分，在选择报考院校时，可以参考以下建议：

1. 在新疆本地，可以报考一些本地较好的专科院校，这些院校通常提供较多的专业选择，且就业相对容易。
2. 在西部地区的高校，如西安电力机械制造高等专科学校、克拉玛依职业技术学院等，这些学校提供的专业可能符合你的兴趣和专业背景。
3. 在东部沿海地区，如江苏、浙江、上海等地的专科院校，如宁波职业技术学院、温州职业技术学院等，这些学校可能提供一些热门专业，但竞争可能会相对激烈。

至于新疆理科341分能报考哪些院校，建议选择较为稳妥的学校有：新疆农业职业技术学院、新疆石河子职业技术学院、新疆建设职业技术学院等。

在选择学校和专业时，还需要考虑自己的兴趣、专业背景以及未来的职业规划。建议查看各学校的招生简章，了解专业的设置和录取分数线，并结合自己的情况进行选择。同时，建议多咨询老师和同学的建议，综合分析，做出最好的选择。