山东交通学院主打专业有航海技术、交通运输（道路运输）、汽车服务工程、交通运输（轨道交通）等。其中，航海技术专业培养符合国际海事组织（IMO）标准的航海技术人才，具备海洋船舶驾驶、航海保障、船舶管理等方面的知识和技能；交通运输专业则注重道路运输方向的教学和科研，培养能在国家及省各级交通规划、设计、管理部门以及铁道、民航、港口等交通规划与管理工作部门从事交通运输规划、设计、管理以及交通运输组织、指挥、决策等方面工作的交通运输工程学科复合型高级技术人才；汽车服务工程专业则培养掌握汽车技术、汽车运用工程、汽车服务工程方面的基本理论和应用技术，能从事汽车设计、制造、检测与维修、汽车营销与贸易、汽车服务系统规划、设计与建设等方面工作的复合型高级工程技术人才。
学校积极推进国际交流与合作，与美国罗耀拉大学、英国诺森比亚大学、澳大利亚西澳大学、新西兰奥克兰大学、加拿大圣弗兰索瓦斯大学等多所国外大学签订了合作协议，为学生提供了更多的留学机会。同时，学校还拥有国家级特色专业1个，省级特色专业6个，省级精品课程11门，校级精品课程38门，这些成绩都充分体现了山东交通学院在专业建设方面的实力和水平。
