合肥学院现有两个校区，分别为巢湖校区和校本部。

巢湖校区主要开设的专业有：材料成型及控制工程、机械电子工程、电子信息工程、计算机科学与技术、生物工程、食品科学与工程、制药工程、交通工程、生物技术、旅游管理等专业。

校本部则主要开设的专业有：经济学、国际经济与贸易、金融学、工商管理、市场营销、会计学、英语、日语、视觉传达设计、环境设计、书法学等专业。

此外，校本部还开设了与美国、英国、加拿大等国家的大学学分转换课程，为学生提供更多的留学机会。

总体来说，合肥学院的专业设置较为全面，涵盖了经济、管理、文学、工学等多个领域，为学生提供了广泛的选择空间。