厦门工学院有**3个学院**，分别是经济与管理学院、人文与外语学院、理学院。

厦门工学院最好的专业是计算机科学与技术专业。该专业在教育部第四次学科评估中获得了B+的成绩，同时在全国大学排名中位列第35位。此外，该专业拥有2000余台高性能计算机，建成了2000多个遍布教学、科研、管理和学生生活的云计算智能服务平台，并拥有4500多平米的国内高校领先的计算机业界名师陈国良院士领衔的计算机科学与技术实验室。