山东农业工程学院的重点学科和重点专业包括：
1. 农业工程类：该学科是学校的优势学科，涵盖了农业机械、农业电气化、农业自动化、农业系统工程等方面，注重应用技术的研究和创新，注重将理论与实践相结合，致力于培养农业工程技术人才。
2. 农学类：该学科是学校的特色学科，涵盖了农学、作物科学、园艺学、林业等多个领域，注重植物学基础理论和应用研究，注重解决农业生产中的实际问题，致力于培养植物生产领域的科技人才。
3. 食品科学与工程类：该学科是学校的热门学科，涵盖了食品科学与工程、食品质量与安全、营养学等多个领域，注重食品科学的基础理论和应用研究，注重食品安全和质量控制，致力于培养食品科学领域的人才。
4. 生物科学类：该学科是学校的优势学科，涵盖了生物科学、生物技术、生物工程等多个领域，注重生物学基础理论和应用研究，注重生物技术的研究和应用，致力于培养生物科学领域的人才。
5. 经济学类：该学科是学校的热门学科，涵盖了经济学、金融学、财政学等多个领域，注重经济学理论和应用研究，注重金融市场和经济发展的研究，致力于培养经济领域的人才。
6. 管理学类：该学科是学校的热门学科，涵盖了工商管理、人力资源管理、市场营销等多个领域，注重管理理论和应用研究，注重企业管理和创新能力的培养，致力于培养管理领域的人才。
此外，山东农业工程学院还拥有一些其他重点专业和重点学科，如计算机科学与技术、环境科学与工程、动物科学等。这些专业和学科都具有较高的学术水平和较强的应用价值，为学生的就业提供了广阔的发展空间。
