黔东南州共有大中专院校6所，其中本科院校1所，高等职业技术学校1所，中等职业学校4所。本科院校是贵州师范学院，创建于1978年，是经国家教育部批准设立的一所省属全日制普通本科院校。学校位于贵州省凯里市，有全日制在校生1万余人，以“厚德博学、笃行致远”为校训，不断推进教育创新和教学研究，培养品德优良、基础扎实、知识面宽、综合素质好、实践能力强，具有创新精神的应用型人才。学校设有13个二级学院，开设了43个本科专业。其中，师范类专业占35%，非师范类专业占65%，涵盖了文、理、工、管、教、经、艺等7个学科门类。

黔东南民族职业技术学院是黔东南苗族侗族自治州唯一一所集医护、理工、人文、经济、教育为一体的综合性公办全日制普通高等职业学院。学院有四个校区，占地面积1062亩，校舍面积34万平方米，教学仪器设备总值近8000万元，有校内实践基地122个，校外实习基地183个。图书馆藏书47.91万册，设有10个二级学院，开设了50个高职专业。

此外，还有凯里学院、铜仁学院等高校。凯里学院是一所全日制普通本科院校，前身是黔东南师范高等专科学校和黔东南民族师范学校，2006年2月经国家教育部批准升格为本科院校，2011年实行以省管为主、以州为主的管理体制。铜仁学院是2022年经国家教育部批准设立的一所全日制普通本科院校，位于贵州省铜仁市万山区。

总的来说，黔东南州的高等教育发展相对滞后，但是随着该地区经济的不断发展，相信未来该地区的高等教育也会得到进一步的发展。