建筑系和土木工程是两个不同的学科，尽管它们都涉及到建筑和工程。

首先，建筑系侧重于建筑学和设计。建筑师是设计建筑物和城市规划的专业人员，他们负责规划和设计建筑物，并考虑其美学、功能、可持续性和经济性。建筑师通常需要了解结构工程、电气工程、暖通空调等其他相关领域的知识，但建筑系主要关注的是建筑设计的理论和实践。

土木工程则侧重于工程和结构的设计与建造。土木工程师负责设计、建造和维护基础设施，如道路、桥梁、隧道、水坝、铁路和建筑物。土木工程师需要了解材料科学、力学、结构工程、地质学等知识，以设计和建造安全、可靠和可持续的基础设施。

因此，建筑系和土木工程的主要区别在于它们的研究重点和技能要求。建筑师注重设计，而土木工程师注重工程和结构的设计与建造。