公司查询员工的社保缴费记录的方法如下：

1. 登录社会保险网上服务平台，使用单位网上服务系统，进入单位用户登录页面。
2. 单位用户可以通过社会保险网上服务平台注册并登录，如果尚未注册则需要先注册。
3. 在网上服务系统里选择“社保缴费”→“缴费信息查询”→“单位缴费信息查询”，可以查询到缴费的详细信息，包括员工社保缴费记录。
4. 在网上服务系统里选择“个人缴费”→“缴费信息查询”→“个人缴费信息查询”，可以查询到个人的社保缴费记录。

以上是查询员工社保缴费记录的方法，希望对您有所帮助。