1. 艺术设计学院：设有室内设计技术、建筑设计技术、环境艺术设计技术、产品造型设计、数字媒体艺术设计等专业。
2. 传媒学院：设有摄影摄像技术、影视动画、计算机网络技术、软件技术、动漫设计与制作等专业。
3. 机电学院：设有机电一体化技术、机械设计与制造、模具设计与制造、工业机器人技术等专业。
4. 财经学院：设有会计、国际贸易实务、投资与理财、电子商务等专业。
5. 建筑学院：设有建设工程管理、建筑工程技术、建筑装饰工程技术等专业。
6. 信息学院：设有计算机应用技术、计算机网络技术、通信技术等专业。
7. 生物化工学院：设有生物制药技术、生物化工工艺、化学制药技术等专业。
8. 外语学院：设有应用英语、商务英语、日语等专业。
9. 基础部：为全校提供公共基础课程的教学和管理工作。
根据学校的办学宗旨和特点，扬州工业职业技术学院的专业设置以工程技术类和应用型为主，注重学生的实践能力和职业技能的培养。此外，学校还设有艺术类专业，如室内设计技术、环境艺术设计技术等专业，为艺术人才提供了专业的学习和发展平台。
