内蒙古高考理科550分能上的最好的大学有9所，分别为华中科技大学、北京外国语大学、上海大学、南京审计大学、南京邮电大学、西南政法大学、上海理工大学、上海海事大学、华东政法大学。

以上这些学校都是比较知名的985、211高校，且录取分数线都在内蒙古本科一批控制线以上，具体以官方发布为准，本排名不分先后。