高三学日语高考不会影响其他科目。国家《考试大纲》对高考外语做出了明确规定，考试科目共有6个，分别是语文、数学、外语、文科综合（政治、历史、地理）和理科综合（物理、化学、生物），其中外语共分为英、日、俄、德、法、西班牙六个语种，考生可以从中选择一种进行考试。

日语虽然是一种不同的语言，但并不会对其他科目的学习产生负面影响。事实上，学习日语可能会帮助学生在其他科目中更好地理解和应用一些概念和原理，因为不同的语言会培养学生的不同思维方式。此外，对于一些专业而言，如国际贸易、旅游管理、翻译等，拥有多种语言能力也是一项优势。

当然，高三学习日语可能会稍微占用一些时间，因为要同时准备高考和其他学科的学习。但是，这并不意味着学日语就一定要晚，事实上，学生在高中阶段开始接触和学习一门新的语言是完全可行的，而且也有很多成功的案例。关键在于合理规划时间，平衡各科的学习，以及坚持学习和练习。