哈尔滨工程大学双一流建设学科名单有1个，即控制科学与工程。该学科是哈尔滨工程大学在原控制科学与工程一级学科下设立的交叉学科，旨在培养具备从事控制科学与工程领域内系统设计、系统分析、系统优化及系统运行与管理等方面工作的能力，并能在控制科学与工程相关的电子信息、自动化、能源、交通、环保、制造、医疗、金融等行业或领域从事技术开发、设计集成、工程应用、管理与决策等方面工作的工程技术人才。