1. 经济学：该专业旨在培养具备现代经济学理论素养和实践能力的高级专门人才，主要课程包括微观经济学、宏观经济学、国际经济学、发展经济学等。
2. 财务管理：该专业旨在培养具备财务管理理论和实践能力的高级专门人才，主要课程包括财务管理学、财务分析学、税法、审计学等。
3. 电子商务：该专业旨在培养具备电子商务系统规划、设计、开发、运营和管理能力的复合型人才，主要课程包括电子商务概论、电子商务安全技术、电子商务物流管理、网络营销等。
4. 旅游管理：该专业旨在培养具备旅游管理理论和实践能力的高级专门人才，主要课程包括旅游学概论、旅游地理学、旅游心理学、旅游规划与设计等。
5. 市场营销：该专业旨在培养具备市场营销理论和实践能力的高级专门人才，主要课程包括市场营销学、市场调研与预测、消费者行为学、品牌管理、销售管理等。
6. 工商管理：该专业旨在培养具备现代企业管理理论和实践能力的高级专门人才，主要课程包括管理学原理、组织行为学、人力资源管理、公司治理等。
福建商学院在2017年被评为“福建省省级硕士学位授予培育学科”，拥有工商管理一级学科硕士点，其工商管理学科团队于2018年被评为“福建省省级重点学科创新团队”。此外，福建商学院还拥有多个省级一流本科专业建设点，如经济学、财务管理、电子商务等。
