福建生物工程职业技术学校（福建生物工程技术职业学院）目前拥有两个校区：泉州校区和福州校区。

泉州校区位于历史文化名城泉州市丰泽区，占地面积约100亩。该校区于2015年建成并投入使用，目前主要承担着生物技术及应用、微生物技术及应用、生物制药技术、生物检验检疫技术、生物质能源及应用技术等专业的教育教学任务。

福州校区占地面积约200亩，位于福建省会城市福州晋安区，距离泉州校区约150公里。该校区于2021年建成并投入使用，目前主要承担着食品检验检测技术、药品质量安全控制技术、医疗器械维护与管理等专业的教育教学任务。

此外，福建生物工程职业技术学校还拥有一个占地约50亩的实践教学基地，位于泉州市丰泽区。该基地主要用于学生的实验实训和技能竞赛，为学生提供了更加全面的实践学习机会。

总的来说，福建生物工程职业技术学校在办学规模和教育教学方面取得了显著的成绩，为福建省乃至全国的生物工程技术领域培养了大量的优秀人才。