基本理论是指一种普遍适用的原则和理念，通常是通过抽象和概括化的思维方式得出的。例如，物理学中的牛顿三定律、心理学中的行为主义理论、哲学中的存在主义理论等，都属于基本理论。它们具有一定的普适性和普遍性，可以在不同领域和学科中应用。

基本知识是指某一学科或领域中最基本的、最核心的概念和知识。例如，在生物学中，细胞、基因、遗传学等是最基本的知识；在数学中，加减乘除、几何学、代数等是最基本的知识。它们是构建其他更高层次知识和理解的基础。

基本理论和基本知识的区别在于，基本理论是一种普遍适用的原则和理念，而基本知识则是在特定领域或学科中的具体概念和知识。基本理论提供了一种宏观的、通用的视角，而基本知识则是在微观层面提供具体的、特定的认识。两者相互关联，因为基本理论常常是由对基本知识的抽象和概括化得出的。

在实际应用中，基本理论常常被用于指导实践，而基本知识则是在实践中被学习和掌握的。例如，在医学领域，生理学是基础学科之一，而生理学中的基本理论（如神经传导、血液循环等）被广泛应用于医学实践。同样，在计算机科学中，计算机科学的基本理论和计算机科学的基本知识（如算法、数据结构、编程语言等）也是相互关联的。