安徽中医药大学重点专业包括中医学、中药学、针灸推拿学、中药制药专业（卓越工程师班）、中医学（英文班）、药学、中西医临床医学、中药学、针灸推拿学、中药资源与开发、藏医学、蒙医学、中医学（“5+3”一体化）、针灸推拿学（“5+3”一体化）、中药学（“5+3”一体化）等。其中，中医学和中西医临床医学为国家重点一级学科，中药学为国家重点二级学科，均进入国家“双一流”建设名单。此外，该校还拥有4个国家特色专业（中医学、针灸推拿学、中药学、药学），1个国家人才培养模式创新实验区，1个国家生命科学与技术人才培养基地，以及10个国家级一流本科专业建设点。

安徽中医药大学在医药卫生领域有着显著的影响，其科研成果在国内外产生了重要的学术影响。该校拥有1个国家重点实验室，1个国家工程技术研究中心，1个国家工程实验室，1个国家国际科技合作基地，1个国家产教融合创新平台，4个国家中医药管理局重点学科，4个国家中医药管理局重点研究室，4个国家中医药管理局综合改革试点学科（中医医史文献、中医基础理论、中药学、方剂学），7个国家中医药管理局三级实验室，以及28个安徽省重点学科和46个安徽省重点实验室。

安徽中医药大学在国内外享有很高的声誉，其卓越的师资力量和高水平的研究成果为该校的发展提供了坚实的基础。该校致力于培养具有创新精神和实践能力的医药卫生人才，为我国的医药卫生事业做出了重要的贡献。