医学会的主要职责是：开展医学学术交流，组织重点学术课题的探讨和科学考察等学术活动，促进学科发展。编辑出版医学学术期刊与音像制品，为会员和医学科技工作者提供学术交流平台。开展继续医学教育，负责继续医学教育项目审核，开展毕业后医学教育。负责国际及港澳台地区医学学术交流。组织医学科技工作者为经济社会发展服务，面向农村和社区开展科普活动，促进人民健康。奖励优秀医学科技成果和人才，发现、培养医学科技人才。向党和政府反映医学科技工作者的意见和要求，维护他们的合法权益。在各级卫生行政部门领导下组织医学科研、医疗技术应用管理和医疗事故技术鉴定工作，组织指导会员和医学科技工作者提供医疗保健咨询和健康服务。推动医学科普宣传工作，提高公众健康科学素养。规划并组织医学科普活动，指导医学书刊的出版发行。在国家卫生健康委员会和中国科学技术协会的领导下，组织开展医学科技评价、标准制定、知识更新培训和咨询服务等工作。组织编写并推广应用医药卫生科普材料。完成中国科学技术协会和有关部门交办的其他事项。
医学会是中国医学科学技术工作者的学术性群众团体，是党和政府联系医学科技工作者的桥梁和纽带，是推动医学科学技术进步、促进人民健康事业发展的重要力量。
