湖南理工学院南湖学院有10个系，分别为：物理系、化学系、生物系、体育系、数学系、计算机科学与信息工程系、文学与新闻传播系、外国语系、电子信息工程系和经济管理系。

该学院开设了28个本科专业，涵盖了理、工、文、管、教、经、法、史、医、艺等9个学科门类。其中，主干课程为物理的本科专业有理论物理、光学、原子物理学、固体物理、理论力学、电动力学等；主干课程为化学的本科专业有无机化学、有机化学、分析化学、物理化学、仪器分析等；主干课程为生物的本科专业有植物学、动物学、生物化学、微生物学、遗传学等。

此外，该学院还开设了体育教育（师范类）、电子信息工程（理工类）、英语（外语类）、汉语言文学（中文类）、国际经济与贸易（经管类）、信息管理与信息系统（计算机类）、工商管理（经管类）、环境设计（艺术类）、音乐学（音乐教育类）等13个专业方向。

湖南理工学院南湖学院的教学特色以培养应用型人才为主，注重实践能力的培养，为学生提供了丰富的实践机会。该学院在课程设置和教学内容上注重与实际应用相结合，通过实践教学环节培养学生解决实际问题的能力。此外，该学院还鼓励学生参加各类学科竞赛和创新创业活动，提高学生的综合素质和竞争力。