南京理工大学紫金学院最好的专业涵盖了多个领域，其中包括机械设计制造及其自动化、电子信息工程、通信工程、计算机科学与技术、软件工程、电子科学与技术、信息管理与信息系统、工商管理、市场营销、财务管理、英语等。这些专业都具有较强的学科优势和实践性，培养了众多优秀的学生，获得了广泛的认可。

其中，机械设计制造及其自动化、电子信息工程、通信工程、计算机科学与技术等专业是学院最为知名的专业之一，具有很高的实践性和创新性。学院还注重学生的综合素质培养，开设了多个选修课程和实践活动，让学生可以根据自己的兴趣和特长进行选择，从而更好地发挥自己的潜力。

此外，学院还积极开展国际交流与合作，与多个国家和地区的高校建立了合作关系，为学生提供了更多的国际交流机会，拓展了他们的国际视野和跨文化交流能力。

总之，南京理工大学紫金学院在专业设置上注重学科交叉和实用性，为学生提供了多样化的选择和发展机会，是值得选择的高等教育机构之一。