复旦大学和北京大学都是中国顶尖的综合性大学，两个学校的硕士研究生教育都有很高的水平。复旦大学和北京大学在学科设置、师资力量、科研实力等方面都非常强大，研究生培养质量也非常高。

从招生人数上看，复旦大学2021年招收硕士研究生人数为4500人左右，而北京大学招收硕士研究生的人数略高于复旦大学，为5000人左右。从录取比例上看，两个学校的录取难度都很大，北大清华的报录比大概在10:1左右，复旦略高一些，大概在9:1左右，竞争非常激烈。

从学科评估结果上看，北京大学在全部学科中均获得了A+以上的评价，其中A+等级的学科数量为42个，而复旦大学只有25个。但是需要注意的是，学科评估结果并不是唯一的评价标准，不同的学科领域、不同的研究方向都有不同的评价标准。

总体来说，复旦大学和北京大学都是非常优秀的硕士研究生培养基地，招生人数和录取难度都非常大。具体选择哪个学校还要根据个人的兴趣爱好、职业规划、学习背景等因素来综合考虑。